Нет, неправильно. Наличие переплаты не является основанием для неприменения штрафа, поскольку имело место занижение налогового обязательства.

Кроме этого, отметим, что погашение обязательств по НДС текущего периода осуществляются путем списания Казначейством денежных средств с электронного счета в системе электронного администрирования. То есть налогоплательщик к этому процессу не имеет никакого отношения и, соответственно, он не может уплатить верную сумму НДС. С электронного счета будут списаны денежные средства в задекларированном плательщиком НДС размере.

Также обратим внимание, что расчеты с бюджетом в связи с представлением уточняющего расчета, уплата предусмотренных НКУ штрафных санкций и пени осуществляются налогоплательщиком с текущего счета в соответствующий бюджет (п. 25 Порядка электронного администрирования НДС, утвержденного постановлением КМУ от 16.10.2014 г. № 569).